Pour être comparable d'un jour à l'autre, la température basale doit être prise dans les conditions précises:
­ Toujours avec le même thermomètre;
­ Toujours de la même manière, la voie elle-même étant sans importance (rectale ou vaginale, mais aussi buccale ou axillaire) car il s'agit d'une mesure comparative;

­ Le matin, au réveil, avant toute activité. L'heure de la mesure et ses variations d'un jour à l'autre n'ont pas d'importance pourvu que la température soit effectivement prise au réveil définitif

Ainsi mesurée tous les matins, même pendant les règles et tout saignement génital, au réveil, la température doit être reportée sur une feuille spéciale. 

Il faut signaler à ce sujet que la plupart des modèles de feuilles de température à la disposition du praticien ou des patientes ont un format trop réduit ou une échelle inadaptée, ce qui en gêne l'interprétation. Il est nécessaire de disposer de feuilles d'un format suffisant avec une échelle parfaitement lisible entre 36° et 37°C, sur lesquelles les variations thermiques apparaîtront nettement, et où il sera possible de noter d'autres indications importantes.

Pour en savoir plus, lire sur Doctissimo :

Le cycle menstruel